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Lexikon der Biologie: spacer

spacer m, „Abstandhalter“, Trennbereich zwischen 2 betrachteten Elementen. a) Bei der Betrachtung kleiner Moleküle wird als spacer meist der zwischen 2 funktionellen Gruppen oder Bereichen liegende Molekülanteil bezeichnet. So werden z.B. bei der Herstellung von Säulen für die Affinitätschromatographie von Proteinen Substanzen eingesetzt, bei denen der als Ligand fungierende Anteil des Moleküls durch einen spacer von der Gruppe getrennt ist, die zur Koppelung des Moleküls an die Säulenmatrix benötigt wird. Durch den spacer als freiem Arm ist der Ligand besser für die an ihn bindenden Faktoren zugänglich. In diesem Zusammenhang werden spacer manchmal auch als Linker bezeichnet (Markierung). b) Als spacer bei der Betrachtung von Genen (Gen) oder Gengruppen wird der DNA-Bereich bezeichnet, der zwischen 2 Genen liegt. Hier spricht man oft auch von intergenischen spacern (IGS) oder intercistronischen Bereichen. Diese spacer finden sich z.B. bei geclusterten Genfamilien wie den rRNA-Genen. Insbesondere bei dieser Gruppe von Genen können noch weitere Arten von spacern unterschieden werden: Als externe spacer werden die Bereiche zwischen den einzelnen rRNA-Geneinheiten bezeichnet. Interne spacer werden die DNA-Abschnitte zwischen dem 18S- und 5,8S-Gen und zwischen dem 5,8S- und 28S-Gen genannt. Die internen spacer (und auch die Teile der externen spacer, die zwischen dem Transkriptionsstart und dem Beginn des 18S rRNA-Gens liegen) werden bei der Transkription der rRNA-Geneinheiten mit transkribiert (daher oft auch als transkribierte spacer [TS] bezeichnet im Gegensatz zu den nicht transkribierten spacern [NTS], welche denjenigen Bereichen der externen spacer entsprechen, die vor dem Transkriptionsstart liegen) und später durch Prozessierung aus dem Primärtranskript entfernt. Palindrom.

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