{"title":"Ribonucleinsuren: Infobox I","body":"Ribonucleinsäuren<\/STRONG>
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<\/BR>Wichtige Parameter zur Charakterisierung von RNA.
<\/BR>a<\/STRONG> Die durch die heterocyclischen Basen bedingte Absorption<\/I> von UV-Licht der Wellenlänge 260 nm, die zur optischen Messung von RNA-Konzentrationen benutzt werden kann (Absorptionsspektrum<\/A>).
<\/BR>b<\/STRONG> Basenzusammensetzung<\/A><\/I>, meßbar nach Hydrolyse der RNA durch Alkali oder RNase zu den Mononucleotiden und anschließende Auftrennung und quantitative Bestimmung derselben durch Papier-Chromatographie<\/A> oder Elektrophorese<\/A>.
<\/BR>c<\/STRONG> Häufigkeit von Basennachbarschaften<\/A><\/I>.
<\/BR>d<\/STRONG> Kettenlängen<\/I>, bestimmbar im Elektronenmikroskop<\/A> oder durch Laufverhalten in der Gelelektrophorese<\/A>. RNA-Kettenlängen werden vorwiegend in Anzahl von Nucleotiden (Basen, Abk. b; oder Kilobasen, Abk. kb) angegeben, jedoch auch durch relative Molekülmassen<\/A>, wobei ein Nucleotidrest im Durchschnitt einer relativen Molekülmasse von 350 entspricht.
<\/BR>e<\/STRONG> Sedimentationskonstante<\/I> (sog. S-Wert) bei Ultrazentrifugation (Dichtegradienten-Zentrifugation<\/A>, Sedimentation<\/A>); z.B. 16S-rRNA, die in der kleinen ribosomalen Untereinheit von Bakterien enthaltene RNA 5S-rRNA und 23S-rRNA, die in der großen ribosomalen Untereinheit enthaltenen RNAs (Ribosomen<\/A>).
<\/BR>f<\/STRONG> Oligonucleotid<\/I>-Fingerprint<\/I> (Fingerprint-Analyse<\/A>, Oligo-fingerprinting<\/A>): radioaktiv oder nicht radioaktiv markierte RNA wird mit Hilfe von Ribonuclease T1<\/SUB> in Guanylsäure-terminierte Oligonucleotide gespalten; diese werden anschließend durch ein zweidimensionales Verfahren aufgetrennt (1. Dimension: Elektrophorese bei pH 3,5, 2. Dimension: Dünnschichtchromatographie). Durch entsprechende Detektionsmethoden (im Fall radioaktiv markierter RNA Autoradiographie<\/A>) wird schließlich das für jede RNA charakteristische zweidimensionale Muster (Fingerprint) markierter Oligonucleotide sichtbar gemacht.
<\/BR>g<\/STRONG> Aufklärung der RNA-Topologie<\/A> mittels RNA-Mapping<\/A><\/I>.
<\/BR>h<\/STRONG> Sequenzanalyse:<\/I> Restriktionsenzyme<\/A> für RNA stehen nicht zur Verfügung, daher ist RNA-Sequenzanalyse technisch viel schwieriger als DNA-Sequenzanalyse und beschränkt sich entweder auf kleine RNAs (tRNAs, kleine rRNAs) oder auf die terminalen Bereiche größerer RNAs. Für die nicht direkt sequenzierbaren Bereiche längerer RNA-Ketten wird häufig der „Umweg“ über die Sequenzierung<\/A> der entsprechenden Gene oder cDNAs<\/A> eingeschlagen."}