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Lexikon der Biologie: Aptamer

Aptamer s, Nucleinsäuremolekülart mit spezifischen Bindeeigenschaften (vgl. Abb.). Aptamere werden in der Regel über in-vitro-Evolution gewonnen.




Aptamer

Beispiele einiger Aptamere:

a Das Theophyllin-Aptamer und die Struktur von Theophyllin. Linien im Aptamer verdeutlichen, wo dessen Sekundärstruktur, aber nicht die Sequenz entscheidend für die Bindung ist (Dissoziationskonstante KD = 0,32 μM).
b Das ATP-Aptamer und dessen Ligand (Dissoziationskonstante KD = 0,7 μM).
c Das Cyanocobalamin-Aptamer und dessen Ligand. Linien verdeutlichen die intramolekularen Wechselwirkungen in der komplizierten Pseudoknotenstruktur (Dissoziationskonstante KD = 0,088 μM).
d Das Arginin-Aptamer, das aus einem Citrullin-Aptamer evolviert wurde, und beide Liganden. Pfeile deuten auf die Punkte, die für die Bindung an Arginin bzw. Citrullin bestimmend sind (Dissoziationskonstante KD = 10,0 μM).

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