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Lexikon der Biologie: Domain-swapping

Domain-swapping s, Bezeichnung für einen molekularbiologischen Versuchsansatz, bei dem Domänen von Proteinen untereinander vertauscht oder mit Domänen von anderen Proteinen gekoppelt werden. Dies wird im allgemeinen durch in-vitro-Rekombination der zugrundeliegenden codierenden DNA-Abschnitte der entsprechenden Gene bewerkstelligt; die neu zusammengesetzten Proteine werden dann meist durch Bakterien hergestellt. Durch Domain-swapping-Experimente kann die Unabhängigkeit und eigenständige Funktion der zu untersuchenden Domänen demonstriert und genauer analysiert werden, als dies im ursprünglichen Protein möglich wäre. So können z. B. bei Transkriptionsfaktoren DNA-bindende Domänen und transkriptionsaktivierende Domänen unterschiedlicher Faktoren getrennt und neu kombiniert werden. In nachfolgenden Analysen dieser chimären Proteine auf ihre Fähigkeit, DNA zu binden und Transkription von Genen zu aktivieren, können die ursprünglichen Domänen im neuen Protein-Kontext charakterisiert werden. Auch bei Enzymen lassen sich unterschiedliche regulatorische Domänen mit unterschiedlichen katalytischen Domänen kombinieren und so die Eigenschaften der Domänen analysieren.

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