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Lexikon der Biologie: Endgruppen

Endgruppen, terminale Gruppen, die an den Enden linearer Makromoleküle (Biopolymere) stehenden Molekülgruppen, z.B. die N- und C-terminalen Aminosäuren von Peptiden und Proteinen oder die 5'- und 3'-terminalen Nucleotide von Oligonucleotiden und Nucleinsäuren. Die Identifizierung von Endgruppen bezeichnet man als Endgruppenbestimmung. Dazu werden die Endgruppen der betreffenden Makromoleküle durch chemische oder enzymatische Umsetzungen markiert (Endgruppenmarkierung; Endmarkierung von DNA-Fragmenten, indirekte Endmarkierung, Markierung), indem an ihre funktionelle Gruppe farbtragende bzw. leicht anfärbbare oder radioaktive Molekülgruppen gekoppelt werden. Anschließend können die Endgruppen zusammen mit den betreffenden markierenden Gruppen abgespalten und als solche identifiziert werden. Endgruppenbestimmungen mit Hilfe von Endgruppenmarkierungen sind von großer Bedeutung für die Sequenzanalyse (Sequenzierung) von Nucleinsäuren (Gentechnologie) und Proteinen. Bei Proteinen und Peptiden erfolgt die Bestimmung N-terminaler Aminosäuren durch den Edmanschen Abbau oder durch Reaktion mit 2,4-Dinitrofluorbenzol; bei Polynucleotiden (RNA oder DNA) durch enzymatische Übertragung radioaktiv markierter Phosphatgruppen, was wahlweise entweder an den 5'-Enden mit Hilfe von Polynucleotid-Kinase oder an den 3'-Enden mit Hilfe von DNA-Polymerasen (bei DNA) bzw. RNA-Ligase (bei RNA) möglich ist.

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