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Lexikon der Biologie: Palindrom

Palindrom s [von griech. palindromos = zurücklaufend], DNA-Abschnitt, der in jedem der beiden Stränge in jeweils entgegengesetzte Richtung orientiert die gleiche Basensequenz enthält
(z.B.

), also rotationssymmetrisch ist. Dies bedeutet auch, daß sich innerhalb eines Palindrom die gleiche Sequenz in umgekehrter Richtung, jedoch bezogen auf beide Stränge, wiederholt

= invers repetitive Sequenz; inverted repeats). Zwischen die beiden Kopien invers repetitiver Sequenzen können nichtrepetitive Abschnitte, sog. spacer, eingeschoben sein. Das Palindrom ist dann unterbrochen ( vgl. Abb. ). Palindrome können eine Kreuzform bilden, denn palindromische Sequenzen rufen immer auch eine Komplementarität der Einzelstränge mit sich selbst hervor. Aus dem gleichen Grund sind diejenigen Bereiche von RNA, die von palindromischen DNA-Bereichen transkribiert (Transkription) werden, mit sich selbst komplementär (Komplementarität) und können durch intramolekulare Basenpaarung Schleifenstrukturen (hairpins, Haarnadelschleifen) ausbilden. Die Erkennungssequenzen und auch die Schnittstellen von Restriktionsenzymen sind meist Palindrome. repeats.



Palindrom

Schema eines unterbrochenen Palindroms, a in linearer, b in Kreuzform. Die beiden Abschnitte "ir" bilden die invers repetitive Sequenz. In ihrer Mitte ist hier ein spacer "sp" eingefügt, der nicht zum invers repetitiven Bereich gehört. Solche spacer können fehlen.

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