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Lexikon der Biologie: repeats

repeats [engl., = Wiederholungen], Bezeichnung für Wiederholungen von identischen oder sehr ähnlichen Sequenzmotiven in Nucleinsäuren und (selten) in Proteinen. Repeats können bei Nucleinsäuren lediglich wenige Nucleotide, aber auch bis zu mehrere hundert Basenpaare lang sein. Die Bezeichnung repeats wird, im Gegensatz zu repetitiven Sequenzen (repetitive DNA, Desoxyribonucleinsäuren), meist bei der Beschreibung von Wiederholungseinheiten innerhalb eines relativ kleinen DNA-Bereichs (bis zu wenigen Kilobasenpaaren) benutzt. Je nach Anordnung der einzelnen Wiederholungseinheiten unterscheidet man verschiedene Arten von repeats ( vgl. Abb. ).



repeats

Arten von repeats:
1) Direkte repeats (direct repeats, direkte Sequenzwiederholungen) liegen vor, wenn ein Sequenzmotiv auf dem gleichen Nucleinsäurestrang in der gleichen Leserichtung (5' → 3') nochmals auftaucht. Diese Anordnung wird auch als Kopf-Schwanz-Orientierung bezeichnet, in bestimmten Fällen auch als Concatemer (Lambda-Phage). Liegen die repeats direkt hintereinander, wird dies als Tandem-Anordnung (tandem repeats) bezeichnet.
2) Indirekte repeats (indirect repeats, indirekte Sequenzwiederholungen) liegen vor, wenn ein Motiv auf einem Strang einmal in der einen Leserichtung (5' → 3') und einmal in der entgegengesetzten Leserichtung (3' → 5') vorliegt. Hier spricht man zum Teil auch von einer Kopf-Kopf-Orientierung.
3) Bei invertierten repeats (inverted repeats, invertierte Sequenzwiederholungen, gegenläufige Sequenzwiederholungen) liegen die identischen Motive auf den beiden komplementären Strängen eines Doppelstrangs in gleicher Leserichtung (5' → 3') vor.
Sehr eng benachbarte invertierte Sequenzwiederholungen werden auch als Palindrome bezeichnet. Die verschiedenen Arten der repeats können mit Hilfe von Computerprogrammen in vorliegenden Nucleinsäuresequenzen aufgefunden und analysiert werden.

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