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Lexikon der Biologie: single-strand conformation polymorphism

single-strand conformation polymorphism m, Abk. SSCP, bezeichnet den Sachverhalt, daß vererbbare, lokal auftretende einzelne Basenpaaraustausche in einem Allel eine Konformationsänderung der DNA bewirken und somit zu einem unterschiedlichen Laufverhalten der Einzelstränge auf einem Polyacrylamidgel führen. Die zu untersuchende DNA-Sequenz wird dabei zuerst mit Hilfe der PCR-Methode (Polymerase-Kettenreaktion) vervielfältigt, wobei die primer hierbei radioaktiv markiert sind (Nachweismethode; Markierung). Das PCR-Produkt wird anschließend denaturiert (Denaturierung), und die dabei entstehenden Einzelstränge werden sofort auf ein Polyacrylamidgel aufgetragen. Die Bestimmung der unterschiedlichen Sequenzen auf dem Gel erfolgt entweder bei symmetrischer oder asymmetrischer PCR, nachdem die DNA der entsprechenden Banden zuerst eluiert wurde (Allel-spezifische Polymerase-Kettenreaktion). Wie bei den RFLPs (Restriktionsfragment-Längenpolymorphismus) können SSCPs als genetische Marker verwendet werden, wobei die RFLPs zur Unterscheidung zweier Allele nur dann brauchbar sind, wenn der DNA-Polymorphismus innerhalb der Erkennungssequenz des Restriktionsenzyms oder die Deletion oder Insertion innerhalb des Restriktionsfragments liegt. Somit stellt die SSCP-Analyse eine Weiterentwicklung für die pränatale Diagnostik und die Verwandtschaftsanalysen dar.

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