Spektrum Spezial: Datengetriebene Wissenschaft: Pfade im Informationsdschungel
Wer die verschlungenen Wege des Stoffwechsels erforscht, benötigt Orientierungshilfe. Die Datenbank
SABIO-RK hilft mit allerlei Finessen der Informatik, benötigte Daten in der Flut an Publikationen zu finden.
Allein vor dem Rechner sitzend,
versunken in einer abstrakten
Welt aus Bits und Bytes – das ist
das Bild, das sich viele von der
Arbeit des Informatikers machen. Tatsächlich
sieht die Realität oft anders aus. So unterstützt
die HITS-Gruppe "Scientific Databases and
Visualization" (SDBV) Systembiologen durch
die Einrichtung und Pflege spezieller Datenbanken.
Das erfordert interdisziplinäre Zusammenarbeit
und regen Austausch mit den
Nutzern.
Systembiologen betrachten Vorgänge in lebenden Organismen nicht isoliert, sondern in größeren Zusammenhängen. Da sich hierbei schnell zu viele Informationen für einen einzigen Kopf anhäufen, arbeiten diese Forscher disziplinübergreifend zusammen. Während Experimentatoren sich zum Beispiel intensiv mit der Messung von Vorgängen innerhalb der Zelle befassen, haben Theoretiker etwa Stoffwechselketten und deren Kombinationen im Blick. Sie versuchen die zu Grunde liegenden biochemischen Prozesse in mathematischen Modellen zu formulieren, um nicht allein das "Wer reagiert mit wem?" zu beantworten, sondern auch Fragen wie "Wie schnell läuft die Reaktionskette bei den gegebenen äußeren Bedingungen ab?"...
Systembiologen betrachten Vorgänge in lebenden Organismen nicht isoliert, sondern in größeren Zusammenhängen. Da sich hierbei schnell zu viele Informationen für einen einzigen Kopf anhäufen, arbeiten diese Forscher disziplinübergreifend zusammen. Während Experimentatoren sich zum Beispiel intensiv mit der Messung von Vorgängen innerhalb der Zelle befassen, haben Theoretiker etwa Stoffwechselketten und deren Kombinationen im Blick. Sie versuchen die zu Grunde liegenden biochemischen Prozesse in mathematischen Modellen zu formulieren, um nicht allein das "Wer reagiert mit wem?" zu beantworten, sondern auch Fragen wie "Wie schnell läuft die Reaktionskette bei den gegebenen äußeren Bedingungen ab?"...
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