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Lexikon der Biologie: trans-Spleißen

trans-Spleißen, intermolekulares Spleißen, im Gegensatz zum normalen Spleißen, bei dem Exonen des gleichen RNA-Moleküls miteinander verbunden werden (auch als cis-Spleißen oder intramolekulares Spleißen bezeichnet), die Verbindung von Exonen nebeneinanderliegender RNA-Moleküle ( ß vgl. Abb. ). Kann z.B. beim Actin-Gen von Caenorhabditis elegans oder psa-Gen in Chloroplasten von Chlamydomonas nachgewiesen werden. Dazu benötigt das eine RNA-Molekül eine 35 bp lange Leader-Sequenz am 3'-Ende (außerhalb der codierenden Sequenz), gefolgt von einer 5'-splicing-site-Sequenz. Die RNA, die beim trans-Spleißen das 5'-Exon liefert, also die Leader-Sequenz besitzt, nennt man auch SL-RNA (spliced leader RNA). Trans-Spleißen ist genauso wie das cis-Spleißen eine Zweischritt-Reaktion. Im ersten Schritt wird die RNA an der 5'-splicing-site des einen Introns (in der Abb. links) aufgeschnitten, und das hierbei generierte 5'-Ende bindet über eine 5'–2'-Verknüpfung an das Adenin (A), das ca. 30 bp vor dem anderen Exonende (3'-Ende, in der Abb. rechts) lokalisiert ist und auch als „branch site“ (Verzweigungspunkt) bezeichnet wird. Es entsteht eine Y-förmige Struktur, aber keine Lariat-Struktur. Im zweiten Schritt wird an der 3'-splicing-site des rechten Introns geschnitten. Die beiden Intronhälften fallen weg, und die verbleibenden Exonen werden miteinander verknüpft. Auch das trans-Spleißen benötigt einige UsnRNPs und Spleißfaktoren für die Bildung des Spleißosoms. Die SL-RNA ersetzt offensichtlich beim trans-Spleißen die U1-snRNA.



trans-Spleißen

Beim trans-Spleißen liefert die SL-RNA ein Exon, das mit dem ersten Exon einer mRNA verbunden wird. Bei diesem Vorgang werden die gleichen Schritte vollzogen wie beim cis-Spleißen, aber es entsteht keine Lariat-Struktur, sondern eine Y-förmige Struktur, weil das Intron aus verschiedenen RNAs stammt.

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